固尔扎周边的动乱还在继续。老固尔扎已经成为塔兰奇苏丹国的首府，而边境仍然遭到盗帮的袭击。考夫曼将军决定终止这种事态，于1871年夏季在科依宾以东召集兵力，打算平定固尔扎。科尔帕可夫斯基将军出任司令，领兵出征，塔兰奇方面只进行了轻度抵抗，阿比尔·欧格拉便投降了，固尔扎于1871年7月4日被俄国人占领。据说占领伊犁河谷的行动是由考夫曼将军发起的，圣彼得堡的当局对此行动甚为不满。俄国外交部赶紧通知中国政府：这次占领是暂时的，只要中国派出足够的兵力接收并维持秩序，就能收回领土。①
① 舒伊勒：《土耳其斯坦》，第185－188页。
可以肯定地说，俄国人占领伊犁的理由，是对阿古柏的野心及其反俄的态度略为担忧。他拒绝俄国人到他的领地从事贸易，当某些有强大官方背景的商人进入喀什噶尔时，他直接买下他们的全部货物，然后将他们送回俄国。看来阿古柏采取反俄态度完全是因为他急于得到俄国的承认，他企图用高压手段来令俄国人对他的权力刮目相看。但是他对考夫曼将军的判断犯了可悲的错误。
俄国人于1868年建立了纳伦要塞，巩固了他们在伊塞克与喀什噶尔之间山区中的地位。这令阿古柏十分不快，他针锋相对，大大加强了阿克苏的防卫。考夫曼将军试图与阿古柏直接接触，就跟他跟浩罕交往一样，可是阿古柏似乎不想直接跟圣彼得堡打交道。